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1856年獲海德堡大學醫學博士學位，其博士論文題為《炎癥引起的變性器官之神經變化》。

1855－1874年，馮特一直在海德堡大學從事教學和研究工作。1858年，受聘擔任H．赫爾姆霍茨（H Helmhltz）的助手。當時規定所有想在巴登接受國家醫學考試的人，都需在生理學實驗室接受一個學期的訓練，于是馮特幫助訓練這些學生，對肌肉的痙攣和神經沖動的傳導作標準化的實驗。在從事生理學研究的同時，馮特關于心理學是獨立的實驗科學的概念開始形成。他對新心理學的最早建議見于《對感官知覺學說的貢獻》一書。在這本書里，馮特除了報道他最初的實驗外，還對新心理學的方法表明了自己的看法，并第一次講到“實驗心理學”。

1873－1874年，馮特刊布其重要的心理學著作《生理心理學》，該書被視作新心理學進展的記錄。

1875年，馮特應聘出任萊比錫大學哲學教授，開始了其漫長但也是最重要的學術時期，他在那里工作了45年。

1879年，馮特在萊比錫大學建立了世界上第一個心理學實驗室。該實驗室的出現，可以說是心理學史上的一個里程碑，標志著新心理科學的誕生。

1920年，馮特寫成自傳《經歷與認識》一書，回憶了他在心理學領域中艱苦奮斗的一生。這本書出版后不久，他便于1920年8月31日在萊比錫去世，享年88歲。

威廉·馮特將內省實驗法引入了心理學。他請對方向內反省自己，然后描寫他們自己對自己的心理工作方法的看法。他創造了特殊的方法來訓練對方，讓他們更仔細和完善地來看待自己，但不過分地解釋自己的心理。這個工作方式與當時的心理學非常不同。當時的心理學更多的是哲學的一個分枝。

威廉·馮特認為，心理與生理是互相關聯的。他的認識論結合了斯賓諾莎、萊布尼茨、康德和黑格爾的理論。

馮特自稱他的心理學為內容心理學，他的某些觀點由鐵欽納繼承，發展成為構造心理學。他的主要貢獻是使心理學轉變成為一門以實驗為基礎的獨立學科。

19世紀中期的心理學家在馮特以前開始進行一些心理學實驗，但那時的研究大都結合在實驗生理學之中，是在生理學實驗室里進行的，由于馮特在理論和研究工作兩方面的努力，才使心理學既脫離哲學又同生理學分開走向真正獨立的道路。

馮特的生理心理學是指一種以生理學方法研究的心理學。他認為心理學是研究人的直接經驗的，它和一切以間接經驗為研究對象的科學不同，因此必須找出一種能夠測定直接經驗的特殊實驗方法。這種實驗方法就是在他所創立的第一個心理實驗室中采用的內省實驗法。

在他之前，由于心理實驗和生理實驗難以區分，純內省的的哲學心理學仍然占有一定的優勢。馮特依循實驗程序得出的內省報告使純內省的哲學心理學開始變為歷史，另一方面，由于內省實驗的研究對象是以直接經驗為特征的心理活動，因而馮特又使實驗心理學和生理心理學實驗嚴格區分開來。盡管馮特的內省實驗法仍有許多難以克服的缺陷，以至引起后繼實驗家的許多非難，但心理學家大都承認他作為第一位實驗心理學家的歷史貢獻。